2014年，中国农科院紧紧围绕科技创新工程的实施，统筹推进科研立项，深化重大成果培育与引导机制，取得了一系列的“顶天立地”成果。
科研立项再创新高。全年新增主持项目1746项，比上年提高8%。其中，国家自然科学基金项目立项292项，优青项目3项，经费合计1.6亿元，立项总数和资金规模再创历史新高，在全国农口单位中稳居第一。国家社科基金重大项目实现零的突破。在国家“973”计划压缩立项规模的背景下，全院立项取得重大突破，新增立项4项，开辟了寄生虫病新领域和粮食作物固氮合成生物新方向。主体科技计划重大项目立项水平跃上新台阶，转基因专项、“863”计划、科技基础性工作专项、行业科研专项等重点重大项目稳定增长，凸显在国家主体科技计划和行业科技计划中的优势占位水平。
创新成果相继涌现。优化科研布局，引导优势科研力量向重大科研成果集聚，为重大科技成果产出奠定基础。在基础研究方面，小麦多倍化杂种优势形成机理、水稻抗条纹叶枯病基因功能、黄瓜苦位合成调控机制等研究取得重大进展，相关学术性成果在《科学（SCIENCE）》《自然（NATURE）》等国际顶尖刊物上发表，彰显了中国农科院持续增强的创新实力。全院以第一作者或通讯作者共发表学术论文4646篇，其中SCI、EI收录近1900篇，收录比例比上年提高21%。在应用研究方面，取得了反刍动物瘦肉精检测技术、阿留申病毒新种检测方法、八行花生捡拾联合收获机等一批具有重大影响的实用性成果。全院获国家专利授权1006项，比上年增长20%，其中发明专利497项；获国家或省级审定农作物新品种106项；获新兽药、农药、肥料登记证7项，软件著作权286项。
成果培育取得成效。在统筹布局全院三级学科体系建设的基础上，统筹研究制定各学科领域与学科方向的成果培育计划目标，着重培育具有“国家队”一流影响力的重大科研成果。全院共获得各类科技成果221项，其中以第一完成单位获得国家奖励成果7项（技术发明奖2项、科技进步奖5项），以参加单位获国家奖励成果2项，获奖总数占农业领域国家奖总数的39%（第一完成单位占30%）。
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