经作所科技人员在Horticulture Research杂志在线发表粉葛全基因组测序研究论文

1月20日,广西农业科学院经济作物研究所严华兵研究员团队在中科院一区TOP期刊Horticulture Research(IF=6.79)杂志在线发表题为“Chromosomal-level genome and multi-omics dataset of Pueraria lobata var. thomsonii provide new insights into legume family and the isoflavone and puerarin biosynthesis pathways”的研究论文,该研究通过PacBio和Hi-C测序构建了粉葛高质量的染色体水平基因组,解析了粉葛的基因组特征,随后利用包括基因组、转录组、代谢组在内的多组学技术深入解析了粉葛重要次生代谢物的生物合成机制,从而为粉葛的资源利用、遗传育种等研究提供了新见解。

经作所科技人员在Horticulture Research杂志在线发表粉葛全基因组测序研究论文

该研究组装获得的粉葛基因组大小为1.37 Gb,Conting N50为593.70 Kb,99.3%的基因组序列被挂载到11条染色体上,BUSCO评估基因组完整性为92.9%。通过注释,共预测得到45270个编码基因,其中94.4%的基因都能得到功能注释,重复序列占比为62.7%。基因组进化分析表明,粉葛与大豆的亲缘关系最为密切,并经历了两次古老的全基因组复制事件。与其他五种豆科植物相比,粉葛共发现2373个特异的基因家族。通过对块茎组织中与葛根素含量相关的基因和代谢物进行了鉴定,共鉴定出572个与葛根素生物合成途径上调的基因,并通过组学数据进一步丰富了235个候选基因。此外,研究确定了6个与葛根素代谢显著相关的8-C-葡萄糖基转移酶(8-C-GT)候选基因。该研究填补了豆科植物的一个关键基因组缺口,为粉葛的遗传改良提供了宝贵的多组学资源。

经作所科技人员在Horticulture Research杂志在线发表粉葛全基因组测序研究论文

经作所科技人员在Horticulture Research杂志在线发表粉葛全基因组测序研究论文

经济作物研究所尚小红副研究员和菲沙基因易欣欣博士为论文的共同第一作者,经济作物研究所严华兵研究员为论文的通讯作者。

                                          经作所  尚小红供稿/供图  严华兵审核

责任编辑:薛臣艺

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

(0)
上一篇 2022年5月7日 上午9:12
下一篇 2022年5月7日 上午9:12

相关推荐