我院水稻所独立完成的鉴定水稻种皮花青素生物合成基因的PCAMP新方法相关论文在国际著名期刊发表

       近日,由广西农业科学院水稻研究所独立完成的题为《Identification of anthocyanin biosynthesis genes in rice pericarp using PCAMP》论文在线发表在国际著名期刊《Plant Biotechnology Journal》(IF:6.305,植物科学一区)上,这也是该期刊上发表的由我院独立完成的首个研究成果。该论文提出了一种性状分组混池及高通量测序的新方法-PCAMP,快速鉴定了10个水稻种皮花青素生物合成基因。PCAMP具有省时、省力、高效等特点,将是解析水稻及其它作物复杂性状的有力工具。水稻所杨行海、夏秀忠及张宗琼副研究员为共同第一作者,邓国富、李丹婷研究员为共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金,国家重点研发计划,广西自然科学基金项目的资助。

       花青素是黄酮类植物色素,生物合成途径涉及多个基因,代谢调控十分复杂。多基因控制的复杂性状对于作物适应环境和人工选择有着重要意义。但是由于在复杂性状中,基因控制方式较为复杂,单个基因可能具有相对小的表型效应,且容易受到环境的影响。因此,解析复杂性状的控制基因一直都是比较困难的。利用传统QTL作图法对复杂性状进行基因定位和遗传机制研究,只能鉴定两个相应的等位基因,并且耗时耗力;SHOREmap需要较大的样本数量;NGM研究的基因属于隐性纯合突变表型;MutMap主要研究的是单基因控制的质量性状;QTL-seq只构建两个表型极端池,关联出与目标性状相关1-2个主效QTLs;GWAS研究对象为自然群体、样本数量大,且检测稀有变异和微效基因存在难度。

 

我院水稻所独立完成的鉴定水稻种皮花青素生物合成基因的PCAMP新方法相关论文在国际著名期刊发表

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