二倍体棉花-亚洲棉(A组)基因组图谱绘制完成

    近日,由中国农业科学院棉花研究所主导的二倍体棉花-亚洲棉(Gossypium arboreum)全基因组测序及图谱绘制完成。相关研究论文已于5月18月在国际权威学术期刊《自然-遗传学(Nature Genetics)》上发表。这是我国继二倍体棉花雷蒙德氏棉基因组图谱绘制完成后,在棉花基因组学研究领域取得的又一项突破性成果。

二倍体棉花-亚洲棉(A组)基因组图谱绘制完成

    据介绍,棉花所于2007年12月联合美国农业部南方平原农业研究中心等优势单位,率先在国际牵头启动了棉花基因组计划(Cotton Genome Project,CGP)。2012年8月完成了二倍体雷蒙德氏棉(D基因组)全基因组图谱的绘制,2014年4月,完成了二倍体亚洲棉(A基因组)全基因组测序工作,两个供体种测序的完成为四倍体棉花基因组的测序组装及进化功能分析奠定了重要基础。
    在本研究中,科研人员对高纯系的亚洲棉品种-石系亚1号进行了全基因组测序,绘制出的亚洲棉基因组约为1,694Mb,利用高分辨率的遗传图谱,将90.4%的亚洲棉序列定位到13条染色体上。注释结果显示,亚洲棉含有41330个编码基因,68.5%的基因组序列是由重复序列组成的,其中95.12%为长末端重复序列(LTR)。进化分析显示,亚洲棉和雷蒙德氏棉在距今约5百万年前由同一祖先分化而来,二者的基因组在染色体水平上保留了高度的共线性,其基因数目和序列也极为相近。研究还发现,相对于雷蒙德氏棉来说,亚洲棉基因组进化过程中发生了更大规模的反转座子插入,这也是其基因组膨胀超过雷蒙德氏棉基因组(近2倍)的主要原因。上述研究结果将对人类认识棉花基因组的复杂性和棉属种间遗传多样性的产生深远影响。
    此外,黄萎病是危害棉花生产的主要病害。抗病基因家族分析结果显示,相对于近缘种可可,抗病相关基因在雷蒙德氏棉基因组中发生了显著扩张,而在亚洲棉中却未发生明显变化,这可能是两个棉种黄萎病抗性存在巨大差异的重要原因,而雷蒙德氏棉中抗病基因的扩增主要是通过串联重复产生的。该发现为抗黄萎病的分子机制研究及抗病性分子育种提供了重要的遗传信息。
    乙烯在促进纤维伸长方面具有重要作用。分析发现,雷蒙德氏棉和亚洲棉在纤维发育上的巨大差别可能主要缘于乙烯生物合成关键基因启动子序列的差异。雷蒙德氏棉中乙烯的过量合成和亚洲棉中乙烯合成不足都会抑制棉花纤维的正常发育。
    二倍体棉花-亚洲棉(A组)基因组图谱绘制完成,对于提升我国棉花科研水平,促进高产、优质、抗逆等重要性状形成的分子机制解析和棉花新品种的分子育种选育具有重要意义。同时也为阐明棉花的起源、进化、揭示四倍体棉种及其他多倍体物种形成过程奠定了坚实的基础。
    该研究是棉花所与深圳华大基因研究院、北京大学、河北农业大学、美国农业部南方平原研究中心等单位合作完成的。

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

(0)
上一篇 2022年5月17日 上午8:05
下一篇 2022年5月17日 上午8:07

相关推荐

  • 项目管理系统 功能

    项目管理系统是一种用于管理项目的工具,可以帮助企业、组织和个人更好地组织和管理项目。本文将介绍项目管理系统的一些常见功能。 1. 任务分配和协作项目管理系统可以提供任务分配和协作的…

    科研百科 2024年7月15日
    56
  • 项目管理系统建设方案(建立项目管理系统)

    建立项目管理系统建立项目管理系统(1)A、用户服务系统B、员工服务C、企业的招聘渠道D、数据2、企业的管理系统3、物流管理系统(1)数据的使用方式是什么(2) 数据的使用方式是什么…

    科研百科 2024年9月29日
    14
  • 低代码开发适用范围

    低代码开发适用范围的扩展 低代码开发是一种快速构建应用程序的方法,通过使用图形化界面和少量的编码,使开发人员能够更快地创建和部署应用程序。它已经在许多行业中得到广泛应用,包括金融、…

    科研百科 2024年3月2日
    89
  • 「IEEE出版丨EI检索」2022教育、网络与信息技术国际会议(ieee ei检索)

    2022教育、网络与信息技术国际会议(ICENIT2022)将于9月2-3日召开,组委会诚邀领域内专家学者、硕博研究生、工程技术人士及有关科研工作者投稿参会。 【主办单位】 武汉工…

    科研百科 2022年8月1日
    463
  • AIRIOT低代码开发平台,10分钟搭建物联网系统(低代码平台开发 roomkit)

    一、低代码的概念 低代码是基于可视化与模型驱动理念,它能够在多数业务场景下实现企业大幅度的降本提效,为专业开发者提供一种全新的高生产力开发方式。另一方面,低代码能够让懂得基础代码的…

    科研百科 2023年12月28日
    131
  • 怎么做好党建课题研究

    做好党建课题研究 随着中国共产党(以下简称“党”)在中国革命和建设中的重要作用日益凸显,党建课题研究已成为推动党的事业不断向前发展的重要力量。然而,党建课题研究需要具备一定的素质和…

    科研百科 2024年10月7日
    31
  • 最新修订的银川市《在职职工医疗互助保障管理办法》来喽,2022年1月1日起实施!

    为了建立健全多层次职工医疗互助体系,保障职工医疗需求,加大职工医疗救助力度,减轻患大病职工医疗负担,根据工作实际,制定本办法。 第一章 总 则 第一条 职工医疗互助是职工基本医疗保…

    科研百科 2022年10月9日
    727
  • 纵向科研项目绩效表格

    纵向科研项目绩效表格 近年来,随着科技的不断发展,纵向科研项目已经成为学术界和工业界的重要力量。纵向科研项目通常涉及多个学科领域,需要跨越多个阶段和年份进行规划和实施。这些项目的成…

    科研百科 2025年3月15日
    1
  • 全国地质灾害通报2020(全国地质灾害项目管理系统)

    全国地质灾害项目管理系统全国地质灾害项目管理系统中的“人口资源管理”问题,正是该市疫情还未崛起,大城市问题更加突出。在美国,人口重组问题得到了国家统计局的高度关注。这也是对日前我国…

    科研百科 2024年9月26日
    29
  • 审计科研项目名称

    审计科研项目 审计科研项目是一种以客观、独立、公正为准则的审计方式,旨在确保审计项目的真实性、准确性和合规性。审计科研项目对于保证财务报表的公正性、透明度和可靠性具有重要的作用。 …

    科研百科 2025年3月22日
    1