我科学家首次完成一种中国小麦重要蚜虫基因组测序装配解析

  8月21日,中国农业科学院植物保护研究所粮食作物害虫监测与控制创新团队首次报道了狄草谷网蚜Sitobion miscanthi 的基因组组装和解析工作。该团队借助先进测序平台完成了狄草谷网蚜廊坊种群(Langfang-1)的基因组测序,成功组装出该蚜的基因组精细图谱草图,并进一步利用Hi-C技术,实现了染色体级别的装载。相关研究成果在线发表在《Gigascience》上。

  小麦蚜虫是我国小麦上最重要的害虫,每年由麦蚜为害引起的小麦减产达10%-40%,严重威胁我国小麦生产与粮食安全。狄草谷网蚜属半翅目、蚜科,是我国各麦区的蚜虫优势种,在中国曾被误定为麦长管蚜Sitobion avenae,目前仍在普遍沿用。狄草谷网蚜为寡食性的刺吸式害虫,主要寄主植物为麦类作物及禾本科杂草;生殖方式分孤雌生殖与有性生殖两种,孤雌生殖种群中存在有翅与无翅的二型性,是研究蚜虫-寄主植物协同进化,比较广食性与寡食性差异机制,有、无性生殖方式交替,翅表型可塑的理想模式昆虫。

  V1.0版本的狄草谷网蚜基因组大小为397.90兆,ContigN50长达2.05兆;含9条scaffolds,与狄草谷网蚜染色体数目一致(2n=18),scaffold N50长达36.26兆;注释出16006个编码基因,重复序列占基因组的26.41%,基因杂合度约为0.573%,GC含量约为30.253%。以上指标均证明该蚜基因组属高杂合、复杂昆虫基因组,相关进展具有突破性。与其他13种蚜虫或节肢动物的系统进化分析显示,狄草谷网蚜与豌豆蚜关系相对较近,大约在7.69-8.83亿年前由同一祖先分化为目前的2个种。

  该蚜精细基因组图谱组装工作的完成,随着后期更多个性化数据装配和分析,新版基因组精细图谱将保持持续更新,对深入开展蚜虫功能进化、表型可塑性等表观遗传学,植物-蚜虫-天敌多营养级互作研究奠定良好基础,在应用及基础研究领域均具有重要意义。

  该研究获得国家重点研究开发项目和国家自然科学基金资助。(通讯员 汪开卷)

  原文链接: https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giz101/5552228?guestAccessKey=\”35d5be3d-f142-404a-8d2e-8b92c0e27a6e

我科学家首次完成一种中国小麦重要蚜虫基因组测序装配解析

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

(0)
上一篇 2022年5月13日 下午12:53
下一篇 2022年5月13日 下午12:55

相关推荐

  • 流动党员管理条例最新

    流动党员管理条例最新 近年来,随着城市化进程的不断加速,流动党员这个群体日益庞大。作为中国共产党的重要力量,流动党员在推动中国特色社会主义事业中发挥着重要作用。然而,随着党员管理手…

    科研百科 2024年10月29日
    0
  • 科研项目编号查询网站

    科研项目编号查询网站:探索科技前沿的利器 随着科技的不断发展,科研项目也在不断推进。科研项目的编号对于科研进展具有重要的指导意义,因此,如何查询科研项目编号成为了一个重要的问题。现…

    科研百科 2025年4月18日
    1
  • 科研项目 技术风险

    科研项目是一项非常复杂的任务,涉及到许多技术风险。这些风险可能包括技术难题、技术缺陷、技术不稳定性和技术安全性等。如果不对这些风险进行有效的管理和控制,可能会导致严重的后果。因此,…

    科研百科 2025年2月13日
    1
  • 本科生做科研项目

    本科生做科研项目 近年来,随着科技的不断发展,本科生也能够参与到科研项目中来,这不仅有助于提高学生的科研能力,还能帮助学生更好地理解专业知识。本文将介绍本科生做科研项目的好处和注意…

    科研百科 2025年4月8日
    1
  • 业主工程项目管理软件

    业主工程项目管理软件 业主工程项目管理软件是一种用于管理业主工程项目的软件工具,可以帮助项目经理和项目团队更好地跟踪项目进度,控制成本,协调资源,并提高项目的成功率。 业主工程项目…

    科研百科 2024年7月21日
    58
  • 环境艺术设计科研项目

    环境艺术设计科研项目 随着城市化进程的不断加速,环境艺术设计已经成为现代建筑和居住环境的重要组成部分。在环境艺术设计中,建筑与周围的自然环境、社会文化、生活方式等因素相互作用,形成…

    科研百科 2025年5月4日
    2
  • 施工项目进度管理系统

    施工项目进度管理系统 随着建筑行业的发展,施工项目的数量也在不断增加。然而,由于施工项目的复杂性和不确定性,传统的手动进度管理方法已经无法适应现代施工项目的需求。因此,建立一个高效…

    科研百科 2024年12月26日
    0
  • 抗疫精神科研项目名称

    抗疫精神科研项目名称: 在新冠疫情肆虐全球的时刻,人类面临着前所未有的挑战。在这场疫情中,人类展现了非凡的抗疫精神,这种精神被称为“抗疫精神”。抗疫精神是人类文明的重要组成部分,它…

    科研百科 2025年4月29日
    1
  • 分享3个超好用的pdf转换软件!一键完成PPT转PDF,简单高效!(pdf转ppt神器)

    我们日常生活中经常使用PDF文件,无论是工作报告,还是学习资料,PDF都是我们的好帮手。 但是,有时候我们需要把PDF文件转换成其他格式,或将其他格式文件转换成PDF格式,如PDF…

    科研百科 2024年4月30日
    92
  • 20系统项目管理师押题

    标题: 20系统项目管理师押题:项目管理系统在项目管理中的应用 随着信息技术的不断发展,项目管理已经成为了企业运营中不可或缺的一部分。系统项目管理师作为项目管理领域的专业人士,对于…

    科研百科 2025年1月23日
    0