我科学家首次完成一种中国小麦重要蚜虫基因组测序装配解析

  8月21日,中国农业科学院植物保护研究所粮食作物害虫监测与控制创新团队首次报道了狄草谷网蚜Sitobion miscanthi 的基因组组装和解析工作。该团队借助先进测序平台完成了狄草谷网蚜廊坊种群(Langfang-1)的基因组测序,成功组装出该蚜的基因组精细图谱草图,并进一步利用Hi-C技术,实现了染色体级别的装载。相关研究成果在线发表在《Gigascience》上。

  小麦蚜虫是我国小麦上最重要的害虫,每年由麦蚜为害引起的小麦减产达10%-40%,严重威胁我国小麦生产与粮食安全。狄草谷网蚜属半翅目、蚜科,是我国各麦区的蚜虫优势种,在中国曾被误定为麦长管蚜Sitobion avenae,目前仍在普遍沿用。狄草谷网蚜为寡食性的刺吸式害虫,主要寄主植物为麦类作物及禾本科杂草;生殖方式分孤雌生殖与有性生殖两种,孤雌生殖种群中存在有翅与无翅的二型性,是研究蚜虫-寄主植物协同进化,比较广食性与寡食性差异机制,有、无性生殖方式交替,翅表型可塑的理想模式昆虫。

  V1.0版本的狄草谷网蚜基因组大小为397.90兆,ContigN50长达2.05兆;含9条scaffolds,与狄草谷网蚜染色体数目一致(2n=18),scaffold N50长达36.26兆;注释出16006个编码基因,重复序列占基因组的26.41%,基因杂合度约为0.573%,GC含量约为30.253%。以上指标均证明该蚜基因组属高杂合、复杂昆虫基因组,相关进展具有突破性。与其他13种蚜虫或节肢动物的系统进化分析显示,狄草谷网蚜与豌豆蚜关系相对较近,大约在7.69-8.83亿年前由同一祖先分化为目前的2个种。

  该蚜精细基因组图谱组装工作的完成,随着后期更多个性化数据装配和分析,新版基因组精细图谱将保持持续更新,对深入开展蚜虫功能进化、表型可塑性等表观遗传学,植物-蚜虫-天敌多营养级互作研究奠定良好基础,在应用及基础研究领域均具有重要意义。

  该研究获得国家重点研究开发项目和国家自然科学基金资助。(通讯员 汪开卷)

  原文链接: https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giz101/5552228?guestAccessKey=\”35d5be3d-f142-404a-8d2e-8b92c0e27a6e

我科学家首次完成一种中国小麦重要蚜虫基因组测序装配解析

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

(0)
上一篇 2022年5月13日 下午12:53
下一篇 2022年5月13日 下午12:55

相关推荐

  • 从《长安的荔枝》学项目管理

    编辑导语:如果此时的你穿越到唐朝,皇帝让你在贵妃诞辰之际将新鲜的荔枝运送到长安,你会怎么做呢?看似简单的一个项目,置身实地后才发现困难重重。本文作者通过「在贵妃诞辰前送新鲜的荔枝到…

    科研百科 2022年10月27日
    484
  • 美容信息系统项目管理

    美容信息系统项目管理 随着现代美容行业的快速发展,美容信息系统项目管理已经成为了企业成功运营的关键因素之一。一个高效的美容信息系统项目管理不仅可以提高客户满意度,还可以帮助企业节省…

    科研百科 2025年1月21日
    0
  • 用友u8固定资产模块如何启用

    用友U8固定资产模块是用于管理企业固定资产的软件模块,可以帮助企业更好地管理和记录固定资产的使用情况。以下是如何启用用友U8固定资产模块的步骤: 1. 下载和安装用友U8软件 首先…

    科研百科 2024年11月7日
    0
  • 研究揭示棉菌共生提高棉花耐盐性的分子机制

      近日,中国农业科学院棉花研究所棉花功能基因组创新团队开展了棉花与真菌共生对棉花耐盐性影响的相关研究,发现棉花可与大丽轮枝菌建立共生关系形成共生体,共生体在盐胁迫下能产生更多的抗…

    科研百科 2022年5月12日
    303
  • 软件开发项目经理月入2.5万 IT精英理财路线图(软件项目经理月薪)

    【理财案例】 广州的周先生今年30岁,是一家软件开发公司的项目经理。公司的业务福利较好,税后平均每月有近2.5万的收入,年底还有2个月薪水的年终奖。周先生女友是其大学同学,现为一家…

    科研百科 2022年11月2日
    372
  • 项目管理单

    项目管理单 项目概述: 本项目旨在开发一个新的社交媒体应用程序,该应用程序将为用户提供一个在线平台,让他们可以分享照片和视频。该应用程序将包括一个用户界面,一个数据分析工具和一个社…

    科研百科 2024年8月17日
    30
  • 国际投标文件进度计划P6输出内容及设置方法

    卷首语 对于投标阶段的P6进度计划编制而言,正确有效的输出是最终展现的关键。 1 Program Milestone 项目里程碑 步骤1:切换到作业窗口; 步骤2:打开过滤器,过滤…

    2022年6月10日
    519
  • 华北区域发布光伏电站并网运行管理实施细则 (2022年修订版)(光伏电站并网运行条件)

    7月1日,华北能源监管局发布通知,就《华北区域光伏电站并网运行管理实施细则 (2022 年修订版)》征求意见。 《实施细则》共计7章41条。原则上适用于通过 10kV 及以上电压等…

    科研百科 2022年10月17日
    214
  • 天镇县:小区管理网格化 服务居民实打实(镇网格化服务中心)

    来源:人民网-山西频道 万家乐移民新区是大同天镇县“十三五”时期最大的易地搬迁城镇集中安置区,如何保证搬得出、稳得住、能致富?该中心坚持党建引领,提升治理能力,围绕巩固拓展脱贫攻坚…

    科研百科 2023年2月8日
    217
  • 合同管理定义

    合同管理的定义和重要性 合同管理是指在组织或个人之间建立并维护合同的过程,包括合同的制定、执行、变更和终止等各个环节,以确保合同的有效性、合法性和合规性。在现代商业环境中,合同管理…

    科研百科 2024年8月25日
    40