新方法可大幅降低基因组基因型鉴定成本

  近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所开发了新的重测序文库制备方法——“AIO-seq”。该方法简化了文库制备的流程,极大地降低了文库制备的成本,为高通量全基因组重测序在育种中应用扫除了高成本障碍。相关研究成果在线发表在《植物-方法(Plant Methods)》上。

新方法可大幅降低基因组基因型鉴定成本

  据常玉晓研究员介绍,全基因组基因型鉴定在育种中具有重要的作用。虽然目前基于二代测序的全基因组基因型鉴定在技术层面已经非常成熟,但是其高昂的价格限制了在育种中的广泛应用。育种家普遍期望单个样本的全基因组基因型鉴定的价格能够降低至10美元左右。

  围绕这一技术难题,该课题组优化了常规的重测序文库制备方法,将传统方法文库扩增后的文库分选和定量这2个步骤,从“每个样品单独操作”的繁琐流程,优化为“多个样品混合操作”的简化流程。通过简化,可以实现一百多份样品混在一起只进行一次文库的分选和定量,大大降低了重测序文库的建库时间成本和试剂成本。此外,该方法还结合质量越来越好的国产建库试剂,进一步降低了试剂成本。最终应用新方法AIO-seq,可以将全基因组基因型鉴定的成本降低到育种家期望的10美元,为NGS在育种中的广泛应用扫除了障碍。

  文章审稿人高度评价该研究成果,表示AIO-seq方法可以加快科研项目进度,将成为重测序的标准方法,在育种研究特别是植物育种中,有重要的应用价值。

  该研究得到中央级公益性科研院所基本科研业务费、中国农科院科技创新工程、深圳市科创委基金,以及广西自然科学基金资助。(通讯员 赵华)

  原文链接:https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-020-00615-3

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

(0)
上一篇 2022年5月13日 上午11:17
下一篇 2022年5月13日 上午11:19

相关推荐

  • 机场项目建设管理系统

    机场项目建设管理系统 机场项目建设管理系统是机场项目建设过程中必不可少的工具,能够帮助项目团队更好地管理项目进度、资源、预算和质量等方面。本文将介绍机场项目建设管理系统的主要功能和…

    科研百科 2025年6月22日
    0
  • 碧蓝航线大小型科研项目

    碧蓝航线是一款热门的二次元航线游戏,玩家可以通过收集和培养各种舰艇,组成自己的舰队,进行战斗和探险。在游戏中,有许多小型的科研项目可以让玩家探索和挑战,下面是一篇介绍碧蓝航线大小型…

    科研百科 2025年4月10日
    1
  • 科研项目参与者简介

    科研项目参与者简介 本次科研项目的参与者是一位来自清华大学计算机系的教授。他叫做李明,是一位计算机科学领域的知名专家。李明教授在计算机科学领域有着丰富的经验和深厚的学术造诣,他的研…

    科研百科 2025年5月8日
    1
  • 系统规划与管理实际项目

    系统规划与管理实际项目 在实际项目中,系统规划与管理是确保项目成功的关键因素之一。良好的系统规划可以帮助团队更好地了解项目的目标,需求,以及如何完成任务。同时,系统管理可以帮助团队…

    科研百科 2025年6月8日
    1
  • 国家级科研项目推荐

    国家级科研项目推荐 随着国家的发展,科研项目的质量和水平也成为了一个越来越重要的话题。为了让您更好地了解国家级科研项目,我们推荐以下项目。 1. “人工智能在医疗保健中的应用研究”…

    科研百科 2025年4月2日
    1
  • 医药研发项目管理系统

    医药研发项目管理系统 随着医药研发的不断升温,医药研发项目管理系统也越来越重要。一个良好的医药研发项目管理系统可以提高医药研发的效率和质量,降低医药研发的风险,同时也可以提高医药研…

    科研百科 2024年8月12日
    50
  • 玉柴集团oa统一验证中心(玉柴办公系统)

    玉柴办公系统: 现代企业的必备工具 随着经济的发展和企业的不断壮大,企业对于办公系统的需求也越来越多样化和复杂化。作为玉柴集团旗下的办公系统,玉柴办公系统不仅提供了高效的办公自动化…

    科研百科 2024年6月7日
    258
  • 国企党建引领高质快速发展路径探析(国企党建引领高质快速发展路径探析论文)

    ——以福建龙溪轴承(集团)股份有限公司为例 文/陈晋辉 2021年6月,龙轴集团党委班子成员、党支部书记在谷文昌纪念馆参观学习并重温入党誓词。 习近平总书记指出,“坚持党对国有企业…

    科研百科 2023年6月9日
    278
  • 科研项目后补助账务处理

    科研项目后补助账务处理 随着科技的不断发展,科研项目越来越受到人们的关注。其中,后补助是科研项目中的一种重要资助方式,用于支持科学研究的经费支出。在进行科研项目后补助账务处理时,需…

    科研百科 2025年4月12日
    3
  • 科研项目能赚钱

    科研项目能赚钱 近年来,随着科技的飞速发展,科研项目逐渐成为人们关注的焦点。科研项目不仅可以为学术界提供新的成果和突破,还可以转化为商业应用,赚钱谋生。 科研项目的商业化应用主要包…

    科研百科 2025年2月21日
    0